天下武功，用则显，不用则隐，《九阴真经》也是一样。在《射雕英雄传》中，它是众人汲汲以求的武功至宝，到了《神雕侠侣》中，却以杨过自创的黯然销魂掌为最，到了《倚天屠龙记》，则又以《九阳神功》取胜。
在《射雕英雄传》中《九阴真经》大放异彩，不断是众位英雄争夺的对象，还为拥有者增添了不少传奇经历。比如梅超风与陈玄风练了九阴真经中的九阴白骨爪，功夫直接进入高手行列，让人闻风丧胆。郭靖因为拥有的九阴真经而直接成了书中战无不胜，攻无不克的英雄豪杰，一灯大师还借助九阴真经治好了内伤，恢复了功力。可是到了《神雕侠侣》中，它输给了杨过自创的黯然销魂掌和玄武剑法，这是不是不科学?
其实这是一种误解。在《神雕侠侣》中，《九阴真经》依然是武学总纲，杨过虽然经常用的是自创的黯然销魂掌和神雕助其炼成的玄武剑，但打底的却是《九阴真经》。
当初，杨过和小龙女在躲避闯入古墓抢夺"玉女心经″的李莫愁的过程中，偶然发现了刻在石室中的部分九阴真经是破解”玉女心经“的方法。杨过和小龙女修炼后，武功直接由二流高手提升到武林一流高手水准，这说明九阴真经中所记载的武功心法对提升人的内力，开启人的潜能非常超前。正是有了九阴真经做基础，杨过才会在练习其他武功的时候事半功倍，否则，他的武功脸一流水平都达不到，还说什么自创武功。
在《神雕侠侣》中，西毒欧阳锋也是《九阴真经》的受惠者，他为黄蓉所骗，逆练《九阴真经》，却练成了一种将所有经脉颠倒移位的厉害武功，且越练越怪，越怪越强。
另外，在《神雕侠侣》中，其他练习过九阴真经的在功夫上都是内功深厚的，招式出神入化的，如郭靖夫妇，黄老邪，洪七公，老顽童，一灯大师，至于功夫有高有低，那应该跟自己的修炼和资质有关，归不到九阴真经上去。
总结:在《神雕侠侣》中，九阴真经依然是所有武学的基础，天下武学的总纲。
